Transformée en distillerie en 1843 par les frères Matheson, Glenmorangie tire son nom du ruisseau Morangie. L’eau pour le brassage vient des sources de la colline Tarlogie ; légèrement calcaire, elle apporte le fruité si particulier de ce malt.

En 1893 la distillerie fut reliée à la voie principale de chemin de fer, elle fut aussi la distillerie pionnière dans le procédé de chauffage des alambics à la vapeur dès 188Reconstruite en 1979, la distillerie a vu le nombre de ses alambics passer de deux à quatre.

En 1996, la nouvelle gamme « Wood finish » a été lancée en hommage au 80ème anniversaire de l’ancien premier ministre britannique Sir Edward Heath. Ces whiskies spéciaux célèbrent l’actitivité de Mac Donald & Muir (propriétaires depuis 1920) dans le domaine du négoce de sherry, porto, madère et bordeaux.